肛周脓肿主要是由肛腺感染引起的。肛腺开口在肛管齿线处的肛窦，肛窦容易受到粪便的污染，进而引发感染，感染蔓延到肛腺后，会导致肛腺发炎化脓，炎症向周围组织扩散就形成了肛周脓肿。据统计，约90%的肛周脓肿是因肛腺感染所致。
肛腺感染相关因素
肛窦损伤： 粪便干结、腹泻等情况容易导致肛窦损伤，比如长期便秘的人，干结的大便通过肛管时很容易擦伤肛窦，使得细菌更容易侵入肛腺。据临床观察，长期便秘人群发生肛周脓肿的风险比正常人群高约2 - 3倍。肛窦炎症： 当肛窦发生炎症时，如果没有及时治疗，炎症会进一步向肛腺蔓延。肛窦炎症初期可能只是局部红肿、疼痛，但如果不加以控制，炎症会逐渐加重并累及肛腺。
身体抵抗力因素
免疫力低下人群： 像糖尿病患者，由于血糖控制不佳，身体的免疫力会受到影响，容易发生各种感染，包括肛周脓肿。研究表明，糖尿病患者发生肛周脓肿的概率是正常人的5 - 10倍。长期服用免疫抑制剂者： 比如器官移植后需要长期服用免疫抑制剂的患者，他们的身体免疫力被抑制，对细菌的抵御能力下降，更容易受到肛腺感染的侵袭而引发肛周脓肿。
其他局部因素
肛门周围皮肤感染： 肛门周围皮肤的疖肿、毛囊炎等感染病灶，如果没有得到有效处理，感染可能会蔓延至肛周组织，进而引发肛周脓肿。例如，肛门周围长了一个小疖肿，若没有及时消炎处理，细菌可能扩散到深部组织导致脓肿形成。肛门外伤： 肛门部位受到外伤，如异物损伤、粗暴的肛门检查等，会使局部皮肤黏膜受损，细菌容易侵入，从而增加肛周脓肿的发生风险。比如进行肛门指检时，如果操作不当造成肛门黏膜损伤，就可能引发感染形成脓肿。