脊椎炎的病因较为复杂，其中遗传因素是一个重要方面，比如约90%的脊椎炎患者与人类白细胞抗原B27（HLA - B27）基因相关，该基因阳性者患脊椎炎的风险比阴性者高很多。
遗传因素相关
基因关联：HLA - B27基因在脊椎炎的发病中起关键作用，携带HLA - B27基因的人群，相对更容易患上脊椎炎。研究发现，HLA - B27阳性的人群中，脊椎炎的发病率明显高于HLA - B27阴性人群。
感染因素影响
肠道感染：某些细菌感染可能与脊椎炎有关，比如肺炎克雷伯菌等肠道细菌。这些细菌的某些成分可能与人体自身组织有相似结构，当人体感染这类细菌后，免疫系统在攻击细菌时可能误伤到脊椎等部位的组织，从而引发脊椎炎。泌尿生殖道感染：一些泌尿生殖道的病原体感染也可能和脊椎炎发病有联系，比如沙眼衣原体等感染，可能通过免疫反应等途径影响脊椎部位，导致炎症发生。
免疫因素异常
免疫系统失调：人体免疫系统出现异常时，可能会攻击自身的脊椎关节等组织。正常情况下，免疫系统能识别自身和外来物质，当免疫系统失衡，就会错误地将脊椎关节当作外来异物进行攻击，引发炎症反应，进而导致脊椎炎的发生。例如，体内一些免疫细胞的功能紊乱，会释放过多炎症因子，对脊椎关节造成损伤。
环境因素作用
潮湿寒冷环境：长期处于潮湿、寒冷的环境中，可能会增加脊椎炎的发病风险。比如在一些气候潮湿、寒冷的地区，居民患脊椎炎的比例相对较高。因为潮湿寒冷的环境可能影响人体血液循环，导致脊椎周围组织的代谢等出现异常，容易引发炎症反应，逐渐发展为脊椎炎。