自然流产后半个月仍有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.子宫收缩不良：自然流产后，子宫需要一段时间来收缩恢复，如果子宫收缩不良，可能会导致血液在子宫内积聚，排出时呈现褐色分泌物。
2.子宫内膜修复：自然流产可能会对子宫内膜造成一定的损伤，子宫内膜需要时间来修复。在修复过程中，可能会有褐色分泌物排出。
3.感染：自然流产后，如果发生感染，如子宫内膜炎、盆腔炎等，也可能导致褐色分泌物持续存在。
4.残留组织：自然流产可能会导致部分胚胎组织残留子宫内，如果残留组织不能及时排出，也会引起褐色分泌物。
5.激素水平不稳定：自然流产后，体内激素水平需要一段时间才能恢复正常，如果激素水平不稳定，也可能导致褐色分泌物。
针对这种情况，建议采取以下措施：
1.就医检查：及时就诊，进行B超等检查，了解子宫内情况，确定褐色分泌物的原因。
2.注意休息：保持充足的休息，避免过度劳累和剧烈运动。
3.注意个人卫生：保持外阴清洁，勤换卫生巾，避免感染。
4.饮食调整：注意饮食清淡，避免辛辣、刺激性食物。
5.按医生建议治疗：根据检查结果，医生可能会给予宫缩剂、抗生素等药物治疗，帮助子宫收缩、预防感染。如果有残留组织，可能需要进行清宫手术。
需要注意的是，每个人的情况可能不同，治疗方法也会因人而异。在自然流产后出现褐色分泌物时，应及时就医，遵循医生的建议进行治疗。同时，要注意观察分泌物的量、颜色和气味的变化，如果出现发热、腹痛等异常情况，应立即就医。