病毒性脑炎的症状多样，常见的有发热、头痛等，部分患者还可能出现精神行为异常等表现。一般来说，患者发病前可能有病毒感染的前驱症状，如发热可达到38℃~40℃左右。
发热表现
体温变化： 病毒性脑炎患者常常会出现发热症状，体温可呈不同程度的升高，多数患者体温在38℃以上，有的甚至能达到40℃。发热可能会持续数天，比如1~2周左右。伴随表现： 发热时可能还伴有寒战，患者会感觉怕冷、发抖，同时身体会比较虚弱，精神状态不佳。
神经系统症状
头痛情况： 头痛是常见症状之一，疼痛程度因人而异，有的是轻微胀痛，有的则较为剧烈，呈搏动性或刺痛感。头痛可能会持续存在，在咳嗽、用力排便等情况下可能会加重。意识改变： 部分患者会出现不同程度的意识障碍，轻者表现为嗜睡，即比正常睡眠时间增多，唤醒后能配合简单问答；重者可出现昏迷，对外界刺激几乎无反应。
精神行为异常
情绪及行为变化： 有些患者会出现精神行为方面的异常，比如情绪不稳定，容易激动、烦躁，或者情绪低落、淡漠。行为上可能表现为胡言乱语，做出一些不符合常理的举动，比如无故奔跑、躁动不安等。认知障碍： 可能会出现认知功能减退，表现为记忆力下降，对近期发生的事情容易遗忘；注意力不集中，难以长时间专注于某件事情；计算力也可能受到影响，比如算简单的算术题会出错。
其他症状
癫痫发作： 少数患者会出现癫痫发作，表现为肢体抽搐、口吐白沫、双眼上翻等症状，发作形式多样，有的是局部肢体抽搐，有的则是全身性大发作。颅神经受损表现： 如果病毒侵犯到颅神经，可能会出现相应的症状，比如视力下降、复视（看东西重影）、面部麻木、吞咽困难等。