慢性肾脏病的引发原因较多，像原发性肾小球疾病就可能导致，据统计，约有一定比例的慢性肾脏病起始于这类疾病。此外，继发性因素也是常见诱因，比如糖尿病肾病，糖尿病患者若血糖控制不佳，病程较长时就容易引发糖尿病肾病进而发展为慢性肾脏病；还有高血压肾小动脉硬化，长期高血压会使肾脏小动脉受损，慢慢影响肾脏功能，引发慢性肾脏病。
一、原发性肾小球疾病相关
免疫复合物沉积： 当机体免疫系统出现异常时，会形成免疫复合物，这些复合物若沉积在肾小球部位，就会引发炎症反应，长期的炎症刺激会逐渐损害肾小球的正常结构和功能，从而导致慢性肾脏病。例如一些自身免疫性疾病相关的肾小球病变，就是因为免疫复合物沉积引发的。肾小球固有细胞损伤： 肾小球内的固有细胞，如系膜细胞、上皮细胞等受到各种因素影响发生损伤，也会参与慢性肾脏病的发展过程。比如某些遗传因素导致的肾小球固有细胞先天性发育异常，就可能使肾脏更容易出现病变走向慢性肾脏病。
二、继发性因素之糖尿病肾病
高血糖的长期毒害： 糖尿病患者体内长期处于高血糖状态，会影响肾脏的微循环。高血糖会使肾小球毛细血管基底膜增厚，肾小球滤过膜的通透性发生改变，导致蛋白质等物质异常漏出，进而影响肾脏的正常功能。一般来说，糖尿病病程超过10年的患者，发生糖尿病肾病的风险会明显增加。肾脏血流动力学改变： 高血糖还会引起肾脏血流动力学的改变，肾小球内高压、高灌注、高滤过的状态持续存在，会进一步加重肾小球的损伤，促使慢性肾脏病的进展。
三、继发性因素之高血压肾小动脉硬化
血压长期升高的冲击： 长期高血压会使肾脏的小动脉发生硬化，血管壁增厚、管腔狭窄，导致肾脏的血液供应减少。肾脏缺血后会分泌一些缩血管物质，进一步加重肾小动脉的收缩，形成恶性循环，最终损害肾脏的结构和功能，引发慢性肾脏病。通常血压长期高于140/90mmHg且控制不佳的患者，更容易出现高血压肾小动脉硬化相关的慢性肾脏病。肾脏结构和功能的逐步破坏： 随着小动脉硬化的进展，肾脏的肾小球会因缺血而发生纤维化、硬化，肾小管也会逐渐萎缩，肾脏的滤过和重吸收功能不断下降，慢慢发展为慢性肾脏病。