慢性肠胃炎的治疗药物需根据具体症状来选。一般来说，对于有反酸、烧心等症状的患者，可使用抑制胃酸分泌的药物，如常用的质子泵抑制剂，像奥美拉唑等，能减少胃酸对胃黏膜的刺激，通常这类药物能较快缓解相关不适。
针对腹痛腹泻的药物
胃肠黏膜保护剂： 比如铝碳酸镁，它可以在胃肠黏膜表面形成一层保护屏障，减轻炎症刺激引起的腹痛等症状。它能快速中和胃酸，缓解胃部不适。益生菌类药物： 像双歧杆菌四联活菌片，能调节肠道菌群平衡，改善肠道功能，对于慢性肠胃炎导致的肠道菌群失调引起的腹泻等情况有帮助，一般需要坚持服用一段时间来调整肠道环境。
针对消化不良的药物
促胃肠动力药： 多潘立酮是比较常用的，它能促进胃肠蠕动，加快胃内食物的排空，缓解消化不良引起的腹胀等症状。通常在饭前半小时左右服用效果较好。消化酶制剂： 如复方消化酶胶囊，里面含有多种消化酶，能帮助消化食物，改善因慢性肠胃炎导致的消化功能减弱引起的消化不良问题，可在吃饭时或饭后服用。
针对有幽门螺杆菌感染的情况
如果慢性肠胃炎伴有幽门螺杆菌感染，一般需要进行联合用药治疗。通常是质子泵抑制剂（如奥美拉唑） + 两种抗生素（如阿莫西林、克拉霉素等） + 铋剂（如枸橼酸铋钾）的四联疗法。不过具体的用药组合需要医生根据患者的实际情况来制定，因为抗生素的选择要考虑患者是否有过敏史等因素。同时，在用药过程中要注意按照医生规定的疗程服用，不能自行随意停药，以免影响治疗效果或导致幽门螺杆菌产生耐药性。