治慢性肠胃炎常用的药物有抑酸剂、胃黏膜保护剂等。比如常用的抑酸剂有质子泵抑制剂，像奥美拉唑，它能抑制胃酸分泌，一般可以缓解因胃酸过多引起的慢性肠胃炎相关症状。
抑酸类药物
质子泵抑制剂： 像奥美拉唑，能特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌，可有效缓解慢性肠胃炎患者因胃酸刺激胃黏膜导致的不适，一般通过抑制胃酸来减轻炎症部位的刺激。H₂受体拮抗剂： 例如雷尼替丁，它能选择性地竞争结合胃壁细胞上的H₂受体，使胃酸分泌减少，对缓解慢性肠胃炎引起的反酸、胃痛等症状有帮助。
胃黏膜保护剂
铋剂： 常见的有枸橼酸铋钾，它可以在胃黏膜表面形成一层保护膜，隔绝胃酸、胃蛋白酶等对胃黏膜的侵袭，促进胃黏膜的修复，常用于慢性肠胃炎伴有胃黏膜损伤的情况。铝碳酸镁： 它能中和胃酸，同时还可以吸附胆汁，对胃黏膜有保护作用，能缓解慢性肠胃炎引起的胃痛、胃胀等症状，服用后在胃内迅速发挥作用。
调节胃肠动力药物
多潘立酮： 可以促进胃肠蠕动，加快胃排空，对于慢性肠胃炎伴有消化不良、腹胀等症状的患者有一定帮助，能改善胃肠的运动功能，缓解不适。莫沙必利： 也是促进胃肠动力的药物，它可以刺激肠肌间神经丛，促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠蠕动，帮助消化，缓解慢性肠胃炎导致的胃肠动力不足相关症状。
微生态制剂
双歧杆菌： 慢性肠胃炎患者肠道菌群可能失调，双歧杆菌可以调节肠道菌群，抑制有害菌的生长，改善肠道微生态环境，有助于肠道功能的恢复，维持肠道的正常生理功能。地衣芽孢杆菌： 能调节肠道菌群平衡，对慢性肠胃炎引起的肠道菌群紊乱有一定的调节作用，促进肠道健康，辅助缓解肠胃炎带来的肠道不适症状。