宝宝晚上睡觉摇头可能由以下原因引起：
1.正常的生理现象：宝宝的前庭功能尚未发育完全，会导致其在睡觉时出现摇头的现象，通常随着月龄的增长会逐渐缓解。
2.湿疹：如果宝宝头部患有湿疹，会因瘙痒而出现摇头的情况，同时还可能伴有皮肤发红、脱屑等症状。
3.缺钙：宝宝生长发育迅速，若体内缺钙，可能导致大脑皮层兴奋，从而引起多汗、摇头等症状。此外，缺钙还可能导致骨骼畸形，如方颅、鸡胸等。
4.头皮瘙痒：宝宝如果不注意头部清洁，可能导致头皮瘙痒，从而出现摇头的情况。
5.中耳炎：如果宝宝患有中耳炎，会因耳部疼痛而出现摇头的情况，同时还可能伴有哭闹、抓耳等症状。
如果宝宝经常出现摇头的情况，建议及时就医，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。