要确诊新型肺炎，首先可以通过流行病学史来初步判断，比如14天内有武汉市及周边地区，或其他有病例报告地区的旅行史或居住史；或发病前14天内曾接触过来自上述地区的发热或有呼吸道症状的患者；或聚集性发病（2周内在小范围如家庭、办公室、学校班级等场所，出现2例及以上发热和/或呼吸道症状的病例）。
实验室检查方面
血常规： 早期白细胞总数正常或减低，淋巴细胞计数减少，部分患者可出现肝酶、乳酸脱氢酶、肌酶、肌红蛋白、肌钙蛋白和铁蛋白增高。病原学检查： 实时荧光RT-PCR检测新型冠状病毒核酸阳性可确诊；病毒基因测序，与已知的新型冠状病毒高度同源也可确诊。
影像学检查情况
胸部CT： 早期呈现多发小斑片影及间质改变，以肺外带明显。进而发展为双肺多发磨玻璃影、浸润影，严重者可出现肺实变，胸腔积液少见。通过胸部CT的典型影像学表现也有助于辅助诊断新型肺炎。