山楂虽好，但也有一些禁忌与可能出现的副作用。一般来说，脾胃虚弱者过量食用山楂可能会引起不适。
一、胃酸过多人群需注意
本身胃酸多的人：山楂含有较多有机酸，像山楂酸等成分，会刺激胃黏膜分泌更多胃酸。对于本身胃酸分泌就过多的人，比如有慢性胃炎、胃溃疡病史的人，大量吃山楂后可能会加重反酸、烧心的症状，严重的还可能导致胃部疼痛加剧。儿童胃酸调节弱：儿童的胃肠功能发育还不完善，胃酸调节能力相对较弱，过量吃山楂更容易出现反酸情况，甚至可能影响食欲，因为胃酸过多会让孩子感觉胃部不适，进而不想吃饭。
二、牙齿敏感者要留意
对酸敏感的牙齿：山楂比较酸，牙齿敏感的人，比如有牙本质过敏的人，吃山楂时，酸性物质会刺激牙齿的敏感部位，引发牙齿酸痛，尤其是吃了较酸的山楂后，这种酸痛感可能会持续一段时间。儿童乳牙期：处于乳牙期的儿童，牙齿还比较娇嫩，吃山楂后如果没有及时清洁口腔，酸性物质容易腐蚀牙齿，增加龋齿的发生风险。
三、血糖偏高者需谨慎
本身血糖控制不佳者：山楂中含有一定糖分，虽然不是超高糖的食物，但对于本身血糖偏高，比如糖尿病患者血糖控制不理想时，大量食用山楂会使血糖升高，不利于血糖的稳定控制，可能会影响病情。儿童糖代谢未成熟：儿童的糖代谢系统还没有完全发育成熟，过量吃山楂摄入较多糖分，也可能对血糖产生一定影响，虽然一般不会像成人糖尿病患者那样严重，但也不建议无节制食用。
四、与某些药物的相互作用
正在服碱性药物者：山楂呈酸性，而碱性药物比如碳酸氢钠等，会与酸性的山楂发生中和反应，从而降低碱性药物的药效。所以正在服用碳酸氢钠等碱性药物的人，要注意避免大量吃山楂。正在服抗凝剂者：有研究发现，山楂可能会有一定的抗血小板聚集作用，正在服用华法林等抗凝剂的人，如果大量吃山楂，可能会增加出血的风险，因为抗凝剂本身就有防止血液凝固的作用，再加上山楂的相关作用，会使出血倾向增加。