发烧且腰疼得厉害，可能是发烧引发的腰部肌肉酸痛，此时需针对发烧和腰疼进行对症治疗。而如果本身患有可导致发烧腰疼的肾脏疾病，比如肾盂肾炎、肾结石等，那就需要尽早前往医院检查确诊并给予相应治疗。
一、对症治疗
1.退烧处理：
(1)若发烧未超过38.5°C，可以运用物理方法来退烧，像是用温水擦拭额头、四肢等部位，同时要多喝水并注意休息；
(2)要是发烧超过38.5°C且物理降温效果不佳，可口服药物进行退烧处理，例如阿司匹林、布洛芬、对乙酰氨基酚等。
2.止痛处理：对于腰疼可暂时使用止痛药，如双氯芬酸钠缓释片、布洛芬缓释胶囊等，同时应暂时减少活动，避免久坐、弯腰，建议卧床休息。
二、对因治疗
1.肾盂肾炎：如果是由细菌感染引起，其临床表现有轻有重，较轻者常出现食欲不振、腰疼、低烧或无发烧等情况；严重者会有头晕、头痛、恶心、呕吐等症状。通常需要借助尿常规、尿细菌培养以及肾功能检查等检查来确诊。治疗主要以降温止痛、抗感染为主，可使用诺氟沙星片、复方磺胺甲噁唑片、头孢哌酮钠等药物，应在医生指导下合理应用。
2.肾结石：这是常见的泌尿外科疾病，多见于男性，可能与代谢异常、生活方式等多种因素相关。结石的典型症状包括腰疼、血尿、排尿困难、发烧等。根据结石大小，可能出现腰部轻微疼痛或剧烈疼痛，伴有感染者可能出现发烧等情况，一般通过尿液检查、CT检查或局部超声检查来确诊。对于结石较小者可采取保守治疗，主要包括镇痛、解痉、排石等，常用药物有消旋山莨菪碱片、复方曲马多片等。若保守治疗效果不理想，或结石较大，则可选择手术治疗，多采用体外冲击波碎石、输尿管镜碎石取石术等方法。
总之，当出现发烧且腰疼得厉害时，需要到医院进行详细咨询和检查，明确病因后，在医生的指导下选择合适的治疗方式进行处理。