脚上跖疣主要是由人类乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV-1型病毒。通常当皮肤有微小破损时，病毒就容易侵入从而引发跖疣。
病毒感染途径
直接接触传播： 如果直接接触了患有跖疣患者的患处，或者接触了被患者污染的物品，比如公共浴室、游泳池的地面等，就有可能被感染上HPV，进而引发跖疣。一般在皮肤有破损的情况下，感染风险会更高。自身接种传播： 患者自身其他部位的皮肤如果有破损，搔抓患处后再接触身体其他部位，就可能把病毒接种到其他部位，导致新的跖疣出现。比如脚上长了跖疣，用手抓挠后，手部接触到身体其他部位，就可能在其他部位长出新的跖疣。
皮肤破损因素
摩擦与压迫： 足部经常受到摩擦和压迫，比如长时间走路、穿不合适的鞋子等，容易使足部皮肤出现微小破损。像长期穿高跟鞋的人，脚部某些部位长期受到挤压，皮肤容易破损，就增加了感染HPV引发跖疣的几率。足部多汗： 足部多汗会使局部皮肤处于潮湿环境，皮肤的屏障功能可能会受到影响，更容易出现破损，从而为HPV的入侵创造条件。例如一些汗腺分泌旺盛的人，脚部容易出汗，若不及时清洁和保持干燥，就比较容易长跖疣。
免疫力因素
免疫力低下人群： 当人体免疫力较低时，比如患有某些慢性疾病、长期熬夜、过度劳累等情况，身体对HPV的抵御能力下降，就更容易感染HPV并患上跖疣。比如长期患有糖尿病的患者，由于身体免疫力相对较弱，相比正常人更容易长跖疣。而青少年和儿童的免疫系统还在发育阶段，相对成年人来说免疫力也较低，也比较容易感染HPV长跖疣。