牙龈萎缩的治疗方法需根据不同病因来定。一般来说，对于由菌斑牙石引起的牙龈萎缩，首先要进行牙周基础治疗。比如通过洗牙，也就是龈上洁治，能清除牙齿表面的菌斑、牙石等刺激物，这通常需要1 - 2次就诊完成，费用大概在几百元不等，能有效控制牙龈炎症进一步发展。
牙周基础治疗
龈上洁治： 医生会使用专门的器械，清除牙龈上方的菌斑、牙石等。一般需要1 - 2次就诊，每次就诊时间约30 - 60分钟，费用因地区和医院不同，大概在200 - 1000元左右。龈下刮治： 如果牙龈萎缩是因为龈下也有牙石菌斑刺激，就需要进行龈下刮治。这是清除位于牙龈沟内或牙周袋内根面上的牙石和菌斑，可能需要多次就诊，每次时间相对较长，费用也会比龈上洁治高一些。
针对病因的治疗
正畸力引起的牙龈萎缩： 如果是正畸过程中施加的力量不当导致的牙龈萎缩，需要调整正畸力。医生会根据牙齿移动情况，逐步调整矫治器的力量，让牙齿移动更平稳，减少对牙龈的不良影响。不良修复体导致的牙龈萎缩： 如果是不合适的假牙等修复体造成牙龈萎缩，需要重新制作修复体。要根据口腔情况定制合适的修复体，保证修复体与牙龈贴合良好，不再刺激牙龈。
手术治疗
膜龈手术： 对于比较严重的牙龈萎缩，可能会采用膜龈手术。比如游离龈瓣移植术，是取自身其他部位的牙龈组织移植到萎缩部位，来覆盖暴露的牙根。手术需要局部麻醉，术后需要注意口腔卫生，避免感染，一般术后1 - 2周可以初步恢复，但完全恢复可能需要几周时间。引导组织再生术： 这种手术是通过引导牙周组织再生，来改善牙龈萎缩情况。利用生物膜等材料创造一个良好的环境，让牙周组织能够再生，从而覆盖部分萎缩的牙龈区域。手术有一定的成功率，但具体效果因个人情况而异。