口腔溃疡的引发原因有多种。一般来说，约20% - 30%的口腔溃疡是由遗传因素导致的，比如父母双方都有复发性口腔溃疡病史，子女患病的概率相对较高。
局部创伤因素：
口腔内机械性损伤： 刷牙时用力过猛，或者不小心咬到口腔黏膜，就容易造成局部创伤，从而引发口腔溃疡。比如刷牙时刷毛过硬，反复摩擦口腔黏膜，就可能形成创伤性溃疡。牙齿残根残冠刺激： 口腔内存在的尖锐牙齿残根、残冠，会持续刺激周围的口腔黏膜，长时间下来也会引发口腔溃疡。例如有一颗牙齿的残根比较尖锐，经常刮蹭旁边的牙龈和黏膜，就容易导致溃疡出现。
营养缺乏因素：
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B12、叶酸等维生素时，容易引发口腔溃疡。比如长期挑食、偏食的人，很可能会出现维生素摄入不足的情况，进而增加口腔溃疡的发生风险。像一些只爱吃肉类，不爱吃蔬菜、水果的人，就较易缺乏相关维生素。微量元素缺乏： 锌、铁等微量元素的缺乏也与口腔溃疡有关。比如体内锌元素含量过低，会影响人体的免疫功能，使得口腔黏膜的抵抗力下降，容易受到病菌侵袭而引发溃疡。
免疫系统因素：
自身免疫反应异常： 当人体免疫系统出现紊乱时，会错误地攻击自身的口腔黏膜组织，从而引发口腔溃疡。例如患有自身免疫性疾病的患者，如白塞病，口腔溃疡往往是其常见的症状之一，而且容易反复发作。免疫力低下： 当人体免疫力低下时，比如长期熬夜、过度劳累、患有慢性疾病等情况，口腔内的病菌就容易大量繁殖，引发口腔溃疡。比如长期熬夜的人，身体处于疲劳状态，免疫力下降，就比较容易长口腔溃疡。