新生儿黄疸偏高通常有多种原因。一般来说，新生儿出生后2 - 3天开始出现黄疸，若胆红素值超过一定范围就属于偏高。其中生理性因素是常见原因之一，胎儿在子宫内处于相对缺氧环境，会刺激红细胞生成，出生后多余红细胞被破坏，产生较多胆红素，一般足月儿生理性黄疸胆红素值不超过12.9mg/dL，早产儿不超过15mg/dL，通常会在2周内消退。
胆红素生成过多
红细胞破坏过多： 新生儿红细胞寿命相对较短，出生后红细胞破坏加快，使得胆红素产生增加。比如胎儿在宫内处于低氧环境，红细胞数量代偿性增多，出生后血氧含量升高，红细胞破坏加速，从而导致胆红素生成过多。血红蛋白分解增加： 新生儿体内血红蛋白量多，其分解产生的胆红素相应也多。例如正常新生儿血红蛋白量比成人高，分解后产生的胆红素量就会超出肝脏代谢能力，进而引起黄疸偏高。
肝脏胆红素代谢障碍
肝脏摄取胆红素能力不足： 新生儿肝脏内Y、Z蛋白含量低，影响胆红素的摄取。一般出生后1周内Y、Z蛋白含量才逐渐达到正常水平，所以出生早期容易出现摄取胆红素不足的情况，导致胆红素在体内积聚，引起黄疸偏高。肝脏结合胆红素功能差： 肝细胞内尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶（UGT）含量低且活性不足，使得未结合胆红素不能有效地转化为结合胆红素。这种酶活性要到出生后1周左右才逐渐增加，所以新生儿早期肝脏结合胆红素的能力较弱，容易出现黄疸偏高。
胆汁排泄障碍
胆管堵塞： 可能存在先天性胆管闭锁等情况，导致胆汁排泄受阻，胆红素反流入血，引起黄疸偏高。先天性胆管闭锁多在出生后1 - 2个月出现进行性黄疸加重，需要及时就医诊治。新生儿肝炎： 病毒感染等原因可引起新生儿肝炎，导致肝细胞功能受损，胆汁排泄不畅，胆红素排出受阻，进而出现黄疸偏高的情况，患儿可能伴有肝脾肿大等表现。