病理性黄疸通常是由多种原因引起的。新生儿病理性黄疸中，约60%的足月儿和80%的早产儿可能因胆红素生成过多导致，比如红细胞增多症，可使胆红素产生增加。还有些是因为肝脏胆红素代谢障碍，像新生儿肝炎综合征，多由病毒感染引起，会影响肝细胞对胆红素的摄取、结合和排泄功能。另外，胆道系统疾病也能引发病理性黄疸，比如先天性胆道闭锁，会阻碍胆红素排出，导致血液中胆红素升高。
胆红素生成过多相关原因
红细胞增多症： 常见于分娩过程中胎盘输血过多，或双胎输血等情况，使得胎儿红细胞数量增多，出生后红细胞破坏，胆红素生成量大幅增加，超过了肝脏处理能力，从而引发黄疸。一般红细胞增多症的患儿外周血红细胞计数会明显高于正常范围。血型不合： 如ABO血型不合或Rh血型不合，母亲和胎儿血型不同，胎儿红细胞会被母体抗体攻击破坏，产生大量胆红素，导致病理性黄疸。ABO血型不合在新生儿中较为常见，发生率约为11.9%。
肝脏胆红素代谢障碍原因
新生儿肝炎综合征： 多在出生后1 - 3周出现黄疸，可能由病毒感染引起，像乙型肝炎病毒、巨细胞病毒等。患儿除了黄疸，还可能伴有食欲减退、呕吐等症状，肝功能检查会发现转氨酶升高等异常。药物因素： 某些药物可能影响肝脏对胆红素的代谢，比如磺胺类药物、某些抗生素等。如果新生儿因疾病使用了这类药物，且肝脏代谢功能不完善时，就容易诱发病理性黄疸。
胆道系统疾病原因
先天性胆道闭锁： 这是一种新生儿期严重黄疸的原因，多在出生后2周左右出现黄疸并进行性加重，皮肤呈黄绿色，大便逐渐变为灰白色。B超检查可发现胆道闭锁的征象，如胆囊不显示等。如果不及时治疗，3个月左右可能发展为肝硬化，严重威胁患儿生命。胆管囊肿： 胆管部位出现囊性扩张，会影响胆红素的正常排泄，导致胆红素在体内积聚，引发黄疸。患儿可能伴有腹部肿块等表现，需要通过影像学检查来明确诊断。