病理性黄疸是由于多种原因导致胆红素代谢异常引起的。新生儿中，约60%的足月儿和80%的早产儿会出现生理性黄疸，但病理性黄疸则需要关注，其发生原因较多。
胆红素生成过多
红细胞增多症： 比如有双胎输血、胎-母输血等情况时，新生儿体内红细胞数量过多，破坏后产生的胆红素就会增多，从而引发病理性黄疸。一般这种情况需要医生评估处理。同族免疫性溶血： 像ABO血型不合或者Rh血型不合等，母亲和胎儿的血型不一致，母体的抗体通过胎盘进入胎儿体内，破坏胎儿红细胞，使得胆红素生成增加，导致病理性黄疸。
肝脏胆红素代谢障碍
肝细胞摄取胆红素能力低下： 某些新生儿出生后可能存在肝细胞摄取胆红素的功能暂时低下的情况，使得胆红素在体内堆积引发黄疸。这种情况可能需要密切监测胆红素水平。肝脏结合胆红素功能缺陷： 一些遗传因素或者疾病状态可能影响肝细胞内尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶的活性，导致肝脏结合胆红素的功能出现缺陷，进而引发病理性黄疸。
胆汁排泄障碍
新生儿肝炎： 多由病毒感染引起，比如乙肝病毒、巨细胞病毒等感染胎儿肝脏，影响胆汁排泄，导致胆红素在体内积聚出现黄疸。先天性胆道闭锁： 这是一种先天性疾病，胆道发育异常，胆汁无法正常排出，胆红素反流入血，引发严重的病理性黄疸，通常需要手术治疗。