甲功三项和甲功五项的主要区别在于包含的甲状腺激素种类不同。甲功三项包括甲状腺素（T3）、甲状腺素（T4）和促甲状腺激素（TSH）；甲功五项则在三项的基础上，还包括游离T3（FT3）和游离T4（FT4）。
TSH是反映甲状腺功能最敏感的指标。FT3、FT4不受血中甲状腺素结合球蛋白（TBG）的影响，能更准确地反映甲状腺的功能状态。T3、T4是甲状腺分泌的主要激素，与甲状腺的功能密切相关。
一般来说，甲功三项主要用于初步评估甲状腺功能，适用于甲状腺功能亢进或减退的初步筛查。而甲功五项则能更全面地了解甲状腺的功能状态，对于甲状腺疾病的诊断和治疗监测更为重要。
需要注意的是，具体选择检查项目应根据个人情况和临床需要来决定。医生会根据患者的症状、体征、病史以及其他相关检查结果，综合判断是否需要进行甲功三项或甲功五项检查。
此外，甲状腺功能异常可能与多种疾病有关，如甲状腺功能亢进、甲状腺功能减退、桥本甲状腺炎等。如果怀疑有甲状腺疾病，应及时就医，进行详细的检查和诊断，并根据医生的建议进行治疗。同时，保持健康的生活方式，如合理饮食、适量运动、减少压力等，对甲状腺健康也非常重要。