肛门瘙痒可能由多种原因引起，比如约60%的肛门瘙痒与局部皮肤病变有关。
局部皮肤病变导致
肛周湿疹：这是常见原因，多因过敏、潮湿等因素引发。皮肤会出现红斑、丘疹，伴有剧烈瘙痒，搔抓后可能渗出、结痂。痔疮相关：患有痔疮时，痔核脱出可能刺激肛周皮肤，导致分泌物增多，长期刺激会引起肛门瘙痒。比如内痔反复脱出，就容易使肛周受刺激出现瘙痒。
寄生虫感染因素
蛲虫感染：多见于儿童，夜间雌虫会爬出肛门产卵，刺激肛周皮肤，引起剧烈瘙痒，尤其在夜间更明显。据统计，儿童感染蛲虫后肛门瘙痒的发生率较高。绦虫等其他寄生虫：较少见，但也可能导致肛门瘙痒，一般与不卫生的饮食等有关。
全身性疾病影响
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中含糖量高，会刺激肛周皮肤，容易引发肛门瘙痒。约有10% - 20%的糖尿病患者会出现皮肤瘙痒症状，其中包括肛门瘙痒。肝胆疾病：如黄疸患者，由于血液中胆盐含量升高，会刺激神经末梢，导致全身皮肤瘙痒，肛门部位也可能受累。
不良生活习惯所致
卫生习惯差：不经常清洗肛门，会使粪便残渣等残留，刺激肛周皮肤引起瘙痒。建议每天至少用温水清洗肛门一次。穿着不透气：长时间穿着紧身、不透气的内裤或裤子，会导致肛周局部温度升高、湿度增大，有利于细菌、真菌滋生，从而引发肛门瘙痒。