肝内胆管结石的治疗需根据具体情况选择，对于无症状的肝内胆管结石，定期复查即可，一般建议每6~12个月做一次腹部B超检查。
手术治疗方式
开腹手术： 这是传统的手术方式，适用于病情较为复杂、结石分布广泛的患者。通过切开腹部，直接进入胆道取出结石。腹腔镜手术： 属于微创手术，具有创伤小、恢复快等优点。例如直径小于2厘米的单发结石，可考虑腹腔镜下胆道镜取石术，术后恢复时间相对开腹手术缩短，一般1周左右可基本恢复正常活动。
非手术治疗情况
药物排石： 对于一些较小的结石，可尝试药物辅助排石。如熊去氧胆酸，它能抑制肝脏胆固醇合成，增加胆汁中胆固醇的溶解，促进结石的溶解，但一般需要连续服用3~6个月才可能有效果，且并非所有患者都适用，需通过B超等检查评估结石情况后决定是否使用。溶石治疗： 适用于结石成分合适的患者，比如胆固醇结石。但溶石过程比较漫长，一般需要持续数月，且在溶石期间需要密切监测肝功能等指标，因为一些溶石药物可能对肝脏有一定影响。
饮食与生活方式调整
饮食控制： 患者应减少高脂肪、高胆固醇食物的摄入，像动物内脏、蛋黄等。每日脂肪摄入量应控制在40克以内，多吃富含维生素的蔬菜水果，如苹果、西兰花等，保证维生素A、C等的摄入，有助于维持胆道健康。多饮水： 每天至少饮用1500~2000毫升的水，这样可以增加尿液生成，稀释胆汁，促进小结石的排出，降低结石形成的风险。