肠炎引起的原因较多，比如感染因素中，细菌感染较为常见，像大肠杆菌感染可能引发肠炎，约有10% - 15%的肠炎由特定细菌感染导致。
感染因素相关
细菌感染： 除了大肠杆菌，沙门氏菌也是常见的引发肠炎的细菌。沙门氏菌感染后，可能会在12 - 36小时内出现腹痛、腹泻等肠炎症状，大便多为水样便或黏液便。病毒感染： 轮状病毒是儿童肠炎常见的致病病毒。每年秋季是轮状病毒肠炎的高发期，主要侵袭6 - 24个月的婴幼儿，会引起呕吐、腹泻，每天腹泻次数可达十几次甚至更多。
饮食因素相关
不洁饮食： 食用了被污染的食物，比如变质的瓜果蔬菜，其中可能滋生大量细菌、霉菌等，摄入后容易引发肠炎。如果吃了被农药残留超标的食物，也可能刺激肠道，导致肠炎发生。食物过敏： 有些人对特定食物过敏，比如对牛奶中的蛋白质过敏。摄入含牛奶蛋白质的食物后，肠道会出现免疫反应，进而引发肠炎，表现为腹泻、腹痛、皮疹等症状。
其他因素相关
药物刺激： 长期服用某些非甾体类抗炎药，像阿司匹林，可能会损伤肠道黏膜，导致肠炎。有研究发现，长期服用这类药物的人群中，约5% - 10%会出现不同程度的肠道炎症表现。自身免疫因素： 一些自身免疫性疾病也可能累及肠道引发肠炎，比如溃疡性结肠炎，这是一种慢性自身免疫性肠炎，病因尚不明确，但与自身免疫系统异常攻击肠道黏膜有关，会出现反复发作的腹泻、黏液脓血便、腹痛等症状。