怀孕45天B超看不到孕囊，可能是以下原因导致的：
1.受孕时间较短：孕囊可能还没有发育到可以通过B超检测到的大小。医生会建议你等待一段时间后再进行复查，以确定孕囊的位置和发育情况。
2.宫外孕：受精卵着床在子宫以外的部位，如输卵管、卵巢、腹腔等，B超检查时可能看不到孕囊。宫外孕是一种危险的情况，需要及时诊断和治疗，以避免破裂出血等并发症。
3.孕囊发育不良：孕囊的发育可能受到多种因素的影响，如染色体异常、激素水平异常等，导致孕囊发育缓慢或停止发育。这种情况下，可能需要进行进一步的检查和评估，以确定是否需要终止妊娠。
4.其他因素：子宫肌瘤、子宫内膜息肉等子宫病变，或口服避孕药等因素，也可能影响孕囊的检测。
针对这种情况，医生可能会采取以下措施：
1.复查B超：通常会建议在一周或十天后再次进行B超检查，以确定孕囊的位置和发育情况。
2.血液检查：医生会进行血液检查，如人绒毛膜促性腺激素（hCG）和孕酮的测定，以帮助判断孕囊的发育情况和妊娠的进展。
3.其他检查：根据具体情况，可能还会进行其他检查，如阴道超声、腹腔镜检查等，以明确诊断。
4.密切观察：在等待检查和诊断的过程中，医生会密切观察你的身体状况，包括是否有阴道出血、腹痛等异常症状。
需要注意的是，每个人的情况都不同，医生会根据你的具体情况制定个性化的诊疗方案。在这个过程中，保持良好的心态，遵循医生的建议，及时进行检查和治疗是非常重要的。如果有任何疑问或担忧，应及时与医生沟通。