怀孕45天做B超看不到孕囊，可能是以下原因导致：
1.怀孕时间较短：孕囊可能还没有发育到可以通过B超看到的大小。建议复查B超，以确定孕囊的位置和发育情况。
2.宫外孕：受精卵在子宫以外的部位着床，如输卵管、卵巢等，也会导致B超看不到孕囊。需要进一步进行血液检查和其他检查，以排除宫外孕的可能。
3.其他问题：如子宫肌瘤、子宫内膜息肉等，也可能影响孕囊的显示。医生可能会建议进行其他检查，如血液检查、宫腔镜等，以确定具体原因。
如果怀孕45天做B超看不到孕囊，建议及时咨询医生，了解具体情况，并根据医生的建议进行进一步的检查和治疗。同时，要注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持心情放松。如果有阴道出血、腹痛等异常情况，应立即就医。