早上起来小腿肌肉酸痛可能由多种原因引起。比如运动因素，如果前一天进行了较剧烈的运动，像跑步、爬山等，运动过程中肌肉会产生乳酸，一般在运动后的1 - 2天内可能会出现晨起小腿肌肉酸痛的情况，这是因为运动导致肌肉无氧代谢增加，乳酸堆积。
运动相关因素
过度运动后： 当进行高强度或者长时间的运动时，小腿肌肉频繁收缩，会使得肌肉内的代谢产物堆积，像前面提到的乳酸。如果运动强度超出了身体的承受能力，就容易在晨起时感觉小腿肌肉酸痛。一般这种情况经过适当休息和拉伸，症状会逐渐缓解。运动方式不当： 如果运动时姿势不正确，比如跑步时步伐过大、登山时腿部用力不当等，会增加小腿肌肉的负担，也容易引发晨起时的酸痛。
疾病因素
腰椎间盘突出症： 当腰椎间盘发生突出时，可能会压迫支配小腿的神经，从而导致小腿肌肉出现酸痛等不适症状。这种情况可能还会伴有下肢麻木、无力等表现，而且症状可能会在晨起时因为体位变化而加重。下肢血管病变： 如下肢静脉曲张、下肢动脉闭塞等疾病，会影响小腿肌肉的血液供应。例如下肢动脉闭塞，会导致小腿肌肉缺血，晨起时就可能出现酸痛，同时可能伴有下肢发凉、肤色改变等情况。
其他因素
寒冷刺激： 夜间睡眠时如果小腿保暖不当，受到寒冷刺激，会引起小腿肌肉的痉挛性收缩，进而导致晨起时酸痛。比如冬季夜间室温较低，没有盖好被子使小腿暴露在外，就容易出现这种情况。营养不良： 当身体缺乏某些营养物质时，也可能出现小腿肌肉酸痛。例如缺乏钙、维生素D等，钙是维持肌肉正常收缩和舒张的重要元素，缺乏时容易导致肌肉兴奋性增高，引发酸痛。