早上起来小腿肌肉酸痛可能由多种原因引起。比如运动相关，若前一天进行了较长时间或较剧烈的运动，像跑步、登山等，就可能导致小腿肌肉酸痛。一般来说，这种情况在休息1 - 2天内可能会有所缓解，但如果酸痛持续时间较长或较为严重，就需要引起注意。
运动过量导致
短时间剧烈运动： 当进行短时间高强度的运动时，比如突然快跑一段距离，小腿肌肉会在运动过程中产生乳酸等代谢产物，这些代谢产物堆积就可能导致早上起来小腿肌肉酸痛。一般这种情况通过适当休息、热敷等方式可以缓解。长时间运动： 如果进行了长时间的运动，像持续徒步几小时，小腿肌肉长时间处于紧张收缩状态，会造成肌肉微细结构损伤，进而引起早上起来的酸痛感。建议运动后进行拉伸放松，帮助缓解肌肉紧张。
肌肉拉伤
运动中拉伤： 在运动过程中，若姿势不当或者用力过猛，很容易造成小腿肌肉拉伤。比如跳远时用力不当，就可能导致小腿肌肉拉伤，早上起来会明显感觉到酸痛，而且可能伴有局部肿胀等情况。慢性拉伤： 长期的不良运动习惯或者姿势问题，也可能引发小腿肌肉的慢性拉伤，日积月累后早上起来就会出现酸痛症状。出现肌肉拉伤后要注意休息，初期可以进行冷敷等处理。
寒冷刺激
夜间保暖不足： 晚上睡觉的时候如果小腿保暖不够，受到寒冷刺激后，小腿肌肉会发生痉挛收缩，从而导致早上起来小腿肌肉酸痛。尤其是在季节更替时，更要注意腿部保暖。环境寒冷： 如果睡眠环境温度过低，也会使小腿肌肉受到寒冷影响，引起早上起来的酸痛。可以通过增添被褥等方式来改善睡眠环境温度。
疾病因素
腰椎间盘突出症： 当腰椎间盘突出压迫到支配小腿的神经时，可能会导致小腿肌肉酸痛，这种情况往往还会伴有下肢麻木等症状。一般多见于长期久坐、弯腰工作的人群。下肢血管病变： 如下肢静脉曲张、动脉粥样硬化等血管疾病，会影响小腿肌肉的血液供应，进而导致早上起来肌肉酸痛。比如下肢静脉曲张患者，腿部血液循环不畅，容易出现这种情况。