头皮毛囊炎常用的药物有抗生素类药物等。一般来说，局部外用药物和系统应用药物是常用的治疗方式。
局部外用药物
莫匹罗星软膏： 这是一种局部外用的抗生素，适用于细菌感染引起的头皮毛囊炎。它能抑制细菌的蛋白质合成，从而起到杀菌作用。可以直接涂抹在头皮患处，每天使用2 - 3次。不过，对莫匹罗星过敏的人不能使用。夫西地酸乳膏： 也是局部外用的抗生素药膏，对于革兰阳性球菌引起的头皮毛囊炎有较好的疗效。使用时取适量均匀涂抹于患处，一天使用2 - 3次。使用过程中如果出现局部皮肤灼烧感、瘙痒等不适，应停止使用并清洗局部药物。
系统应用药物
头孢类抗生素： 如果头皮毛囊炎比较严重，有扩散趋势或者局部治疗效果不佳时，可能会系统应用头孢类抗生素。比如头孢呋辛等，通过抑制细菌细胞壁的合成来发挥杀菌作用。但对头孢菌素类药物过敏的人禁用，使用前需要做皮试。大环内酯类抗生素： 像红霉素等大环内酯类药物也可用于治疗头皮毛囊炎。它通过抑制细菌蛋白质的合成来发挥抗菌作用。口服红霉素时，可能会有胃肠道不适等不良反应，如恶心、呕吐等，空腹服用时不良反应可能更明显。
注意事项
日常护理配合： 在使用药物治疗头皮毛囊炎的同时，要注意保持头皮清洁，建议每天用温和的洗发水清洗头发，但不要过度清洗，以免破坏头皮的正常屏障。还要注意避免搔抓头皮，防止感染进一步加重。特殊人群： 儿童患有头皮毛囊炎使用药物时要谨慎，儿童使用局部外用抗生素药膏时，要在成人监护下使用，避免儿童误服。孕妇如果患有头皮毛囊炎，使用药物需要特别谨慎，应在医生的指导下选择相对安全的药物，因为某些药物可能会对胎儿产生影响。