高烧通常指高热，孩子在晚上出现高热39℃可能是由多种原因引发的，比如中暑、细菌性痢疾或者流行性腮腺炎等。孩子高热后，可能会有呼吸困难乃至抽搐等多种表现，应依据医生指导选择物理治疗或药物治疗等方法来缓解。
一、中暑：当孩子处于温度过高的环境中，会对体温调节中枢产生影响从而导致中暑。这时家长应立刻将孩子转移出中暑环境，给孩子额头贴上冰敷贴，或者用温水擦拭孩子四肢，这样可以起到局部降温的作用，之后要及时给孩子补充清凉含盐饮料。
二、细菌性痢疾：孩子受到志贺菌感染后，会引发细菌性痢疾，发病后也会使体温达到39℃左右。家长首先可采取物理降温的方式来控制孩子体温，以避免大汗虚脱。同时还应在医生指导下服用复方磺胺甲噁唑颗粒、头孢拉定干混悬剂等药物进行治疗。
三、流行性腮腺炎：孩子感染流行性腮腺炎病毒后会引发流行性腮腺炎，在病毒的刺激下也会导致高热。可以在医生指导下服用小儿肺热平胶囊、羚羊清肺散等药物来进行降温。
总之，孩子晚上高热39℃可能有多种病因，要根据具体情况采取相应的应对措施，必要时一定要及时就医，遵循医生的建议进行治疗和护理。