结肠炎的治疗药物需根据病情类型等因素选择，常用的有氨基水杨酸制剂等。一般来说，5-氨基水杨酸类药物对轻中度结肠炎有较好疗效，比如美沙拉嗪，它能在肠道局部发挥作用，减轻炎症反应。
氨基水杨酸制剂类药物
柳氮磺吡啶： 是常用的氨基水杨酸制剂，它在肠道内被分解为5-氨基水杨酸和磺胺吡啶，其中5-氨基水杨酸可抑制炎症介质的产生，从而缓解结肠炎症状，但部分患者可能对磺胺过敏，使用前需注意。美沙拉嗪： 分为口服制剂和灌肠剂等不同剂型，口服美沙拉嗪能到达肠道发挥作用，对于轻中度的溃疡性结肠炎等结肠炎有较好疗效；美沙拉嗪灌肠剂则更适用于病变局限在直肠的结肠炎患者，直接作用于病变部位。
糖皮质激素类药物
泼尼松： 属于全身性应用的糖皮质激素，对于氨基水杨酸制剂疗效不佳的中重度结肠炎患者可考虑使用。不过长期使用可能会有较多副作用，像引起骨质疏松、感染风险增加等问题，所以需在医生严格监测下使用。氢化可的松琥珀酸钠： 可用于重度结肠炎的短期治疗，一般通过静脉给药，能快速减轻炎症反应，但同样要注意其可能带来的如血糖升高、电解质紊乱等副作用。
免疫抑制剂类药物
硫唑嘌呤： 适用于对糖皮质激素治疗效果不佳或依赖的结肠炎患者，它可以抑制免疫系统的过度反应。不过使用这类药物需要定期监测血常规、肝功能等指标，因为可能会引起白细胞减少、肝功能损害等不良反应。巯嘌呤： 作用机制与硫唑嘌呤类似，也可用于结肠炎的治疗，在使用过程中同样要密切关注药物的不良反应。
生物制剂类药物
英夫利昔单抗： 对于传统治疗无效的重度结肠炎患者可能是一种选择，它通过特异性结合肿瘤坏死因子 - α来发挥作用，能有效减轻炎症，但这类药物价格相对较高，且可能增加感染等风险，使用前需经过严格评估。