胃肠型感冒主要是由病毒感染引起的，其中最常见的是柯萨奇病毒，约占引发胃肠型感冒病毒的一半左右。
病毒感染是主因
柯萨奇病毒感染： 柯萨奇病毒通过消化道或呼吸道侵入人体，当人体免疫力下降时，就容易被这种病毒盯上，从而引发胃肠型感冒。它会影响胃肠道功能，导致恶心、呕吐、腹泻等症状。其他病毒感染： 像埃可病毒等也可能引起胃肠型感冒。这些病毒同样会在人体的消化道或呼吸道黏膜处繁殖，进而引发一系列胃肠道不适症状。
环境因素影响
气温突变： 当气温在短时间内大幅下降，比如一天内气温从25℃左右骤降到15℃以下，人体的胃肠道容易受到刺激，抵抗力下降，就增加了感染病毒引发胃肠型感冒的风险。空气污染： 在空气污染较为严重的环境中，空气中存在大量的病毒、细菌等病原体。长期处于这样的环境中，呼吸道和胃肠道接触到病原体的机会增多，也容易诱发胃肠型感冒。
自身免疫力状况
儿童免疫力低： 儿童的免疫系统尚未完全发育成熟，相比成年人更容易受到病毒侵袭。比如3岁以下的幼儿，自身抵抗力较弱，患胃肠型感冒的几率相对较高。免疫力低下人群： 患有慢性疾病，如糖尿病、艾滋病等的人群，或者长期服用免疫抑制剂的人，他们的免疫力处于较低水平，对病毒的抵御能力减弱，更容易患上胃肠型感冒。