肠胃型感冒主要是由病毒感染引起的，其中最常见的是柯萨奇病毒，同时也可能伴有细菌混合感染。一般来说，约有10%-20%的肠胃型感冒是由细菌感染引发的。
病毒感染是主因
柯萨奇病毒： 这是引发肠胃型感冒的常见病毒之一，它会侵袭胃肠道，导致胃肠道功能紊乱，出现恶心、呕吐、腹泻等症状。比如在人群密集的场所，容易通过飞沫、接触等方式感染柯萨奇病毒而引发肠胃型感冒。其他病毒： 像埃可病毒等也可能引起肠胃型感冒，这些病毒同样会对胃肠道黏膜产生刺激，影响胃肠道的正常消化和吸收功能。
环境因素易诱发
气温变化： 当气温突然降低时，人体的免疫力可能会受到一定影响，从而更容易受到病毒的侵袭。例如在季节交替的时候，早晚温差较大，如果没有及时增减衣物，就容易患上肠胃型感冒。空气污染： 空气中的一些有害颗粒、病菌等污染物增多时，也会增加感染肠胃型感冒的风险。比如在雾霾天气较多的时候，人们长时间处于这样的环境中，呼吸道和胃肠道的防御功能可能会下降，病毒就更容易侵入引发疾病。
自身免疫力影响
免疫力低下人群： 比如老年人、儿童以及患有慢性疾病的人群，他们的身体免疫力相对较弱，对病毒的抵御能力较差，更容易患上肠胃型感冒。老年人身体机能衰退，儿童免疫系统还未完全发育成熟，慢性疾病患者自身的健康状态不佳，这些因素都使得他们在面对病毒时更容易被感染。生活作息不规律： 长期熬夜、过度劳累等会导致身体免疫力下降，增加肠胃型感冒的发病几率。当人体处于疲劳状态时，身体的各项机能都会受到影响，包括免疫系统，此时病毒就有可乘之机，容易引发肠胃型感冒。