肠胃感冒主要是由病毒感染引起的，其中最常见的是柯萨奇病毒，约占引发肠胃感冒病毒的40%左右。
病毒感染是主因
柯萨奇病毒感染： 柯萨奇病毒分为A组和B组，A组中的某些亚型以及B组的部分亚型容易引发肠胃感冒，它会侵袭胃肠道，导致胃肠道功能紊乱，出现恶心、呕吐、腹泻等症状。埃可病毒感染： 埃可病毒也是引起肠胃感冒的常见病毒之一，它会在人体内繁殖，影响肠道的正常蠕动和消化吸收功能，从而引发肠胃不适的一系列症状。
免疫力低下易发病
儿童群体： 儿童的免疫系统还未完全发育成熟，相比成年人更容易受到病毒的侵袭。比如3岁以下的幼儿，由于免疫系统更脆弱，感染病毒引发肠胃感冒的几率相对较高。老年人： 老年人随着年龄增长，身体的免疫力逐渐下降，抗病能力减弱，也容易感染病毒患上肠胃感冒。
环境因素的影响
温差变化： 当人体受到较大的温差刺激时，比如从炎热的室外突然进入空调温度很低的室内，呼吸道和胃肠道的血管会突然收缩，导致免疫力下降，容易让病毒乘虚而入引发肠胃感冒。尤其是在季节交替的时候，温差变化较大，更易出现这种情况。公共场所传播： 在人员密集且通风不良的公共场所，如商场、公交车等，病毒更容易在空气中传播。如果接触了被病毒污染的物品后又触摸口鼻，就很容易感染病毒引发肠胃感冒。