怀孕50天做B超看不到孕囊，可能是以下原因：
1.生理因素：可能是实际受孕时间较短，孕囊还未到达子宫，或者孕囊太小，B超无法检测到。这种情况可以在一周后复查B超，以确定孕囊的位置和发育情况。
2.宫外孕：受精卵在子宫以外的部位着床，如输卵管、卵巢、腹腔等，就会导致宫外孕。宫外孕时，B超也可能看不到孕囊。宫外孕是一种危险的情况，可能会引起大出血，甚至危及生命。如果怀疑宫外孕，需要进一步进行血液检查和其他检查，以明确诊断。
3.胎停育：孕囊发育到一定阶段后停止发育，B超检查显示孕囊不完整、无胎心搏动或胎芽。胎停育可能是由于染色体异常、母体疾病、环境因素等引起的。如果确诊胎停育，需要及时进行清宫手术，以清除宫腔内的残留物。
4.其他：子宫肌瘤、子宫内膜息肉等子宫疾病，也可能影响孕囊的着床和发育。此外，内分泌失调、免疫系统异常等也可能导致怀孕困难或孕囊发育异常。
需要注意的是，每个人的情况都可能不同，具体原因需要结合临床症状、检查结果等综合判断。如果对怀孕50天做B超看不到孕囊的情况有疑虑，建议及时咨询医生，医生会根据具体情况进行详细的解释和建议。同时，在等待复查或进一步检查的过程中，应注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持良好的心态。如果出现阴道出血、腹痛等异常情况，应立即就医。