怀孕50天时做B超是否能看到孕囊，需要根据具体情况进行分析，可能有以下几种情况：
1.正常情况：如果平时月经周期规律，怀孕50天时做B超通常可以看到孕囊。但如果月经周期较长，排卵较晚，孕囊可能还没有发育到可以看到的大小。
2.宫外孕：宫外孕是指受精卵在子宫以外的部位着床发育，常见的部位是输卵管。宫外孕时，孕囊无法在子宫内正常发育，做B超可能看不到孕囊。
3.胎停育：胎停育是指胚胎发育到一定阶段后停止发育，B超检查可以发现孕囊内没有胎芽、胎心搏动或孕囊形态不规则。
4.其他情况：如果孕妇存在子宫畸形、子宫肌瘤等情况，也可能会影响孕囊的发育和显示。
因此，怀孕50天时做B超看不到孕囊，并不一定是异常情况。医生会根据孕妇的具体情况，如月经周期、hcg水平、症状等，进行综合判断。如果医生怀疑有宫外孕或其他异常情况，可能会进一步进行检查，如血hcg监测、孕酮测定、阴道超声等。如果确诊为宫外孕，需要及时治疗，以避免发生危险。
如果孕妇没有任何不适，可以在1-2周后复查B超，以确定孕囊的发育情况。在等待复查期间，如果出现阴道出血、腹痛等异常情况，应立即就医。同时，孕妇要注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持良好的心态。