怀孕50天做B超看不到孕囊，可能是以下原因导致的：
1.生理原因：
受孕时间晚：虽然末次月经是怀孕的第1天，但实际受孕时间可能较晚，孕囊还没有到达子宫，或者还很小，B超无法检测到。
胚胎发育不良：如果孕囊发育缓慢或停止发育，也可能导致看不到孕囊。
2.病理原因：
宫外孕：受精卵在子宫以外的部位着床，如输卵管、卵巢等，B超也无法看到孕囊。
葡萄胎：一种异常妊娠，子宫内充满了水泡状物质，而不是正常的胎儿组织，B超也会显示异常。
子宫肌瘤：子宫内的肌瘤可能会影响孕囊的着床和发育，导致看不到孕囊。
如果怀孕50天做B超看不到孕囊，医生可能会建议进行以下检查：
1.血HCG和孕酮检测：这可以帮助确定是否怀孕，以及孕囊的发育情况。
2.复查B超：一般会在一周后再次进行B超检查，以确定孕囊的位置和发育情况。
3.其他检查：如果怀疑有宫外孕或其他病理情况，可能需要进行腹腔镜检查、磁共振成像（MRI）等进一步检查。
需要注意的是，每个人的情况都不同，医生会根据具体情况制定个性化的诊疗方案。如果对检查结果有疑问或担忧，应及时与医生沟通，了解更多信息。同时，在等待检查结果期间，应注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持良好的心态。