新生婴儿黄疸主要是因为新生儿体内胆红素代谢特点导致的。大约60%的足月儿和80%的早产儿在出生后会出现生理性黄疸，一般在出生后2-3天出现，4-5天达到高峰。
生理性黄疸的原因
胆红素生成过多： 新生儿红细胞寿命短，仅70-90天，比成人短很多，所以红细胞破坏多，产生的胆红素也就多。而且新生儿肝脏处理胆红素的能力还没完全发育好，导致胆红素生成相对过多。肝脏代谢胆红素能力不足： 新生儿肝细胞内摄取胆红素的Y、Z蛋白含量低，出生后1周才达到成人水平。同时，肝细胞内尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶（UDPGT）的量及活性不足，不能将未结合胆红素充分转化为结合胆红素排出体外。
病理性黄疸的原因
感染因素： 新生儿肝炎多由病毒引起，如乙型肝炎病毒、巨细胞病毒等，这些病毒感染可影响肝细胞对胆红素的代谢。新生儿败血症也会引发病理性黄疸，细菌产生的毒素会干扰肝细胞的正常功能，导致胆红素代谢异常。胆道闭锁： 这是一种先天性疾病，胆道闭锁会使胆红素排出受阻，胆汁淤积在肝脏内，进而导致血液中胆红素水平升高，引起黄疸。这种情况通常在出生后2周左右黄疸逐渐加重，而且粪便颜色会变浅，甚至呈白陶土色。母乳性黄疸： 部分母乳喂养的新生儿会出现母乳性黄疸，可能与母乳中的某些物质抑制了肝脏内葡萄糖醛酸转移酶的活性有关。一般在出生后1-3周出现黄疸，持续时间较长，有的可长达1-3个月，但婴儿一般情况良好，停喂母乳3-5天后黄疸会明显减轻。
其他可能因素
红细胞形态异常： 如遗传性球形红细胞增多症、椭圆形红细胞增多症等，这些红细胞结构异常，容易被破坏，导致胆红素生成增加，引发黄疸。药物因素： 有些药物可能会引起新生儿黄疸，比如磺胺类、呋喃类药物等，它们可能会影响胆红素的代谢过程，导致黄疸发生。