肛周脓肿主要是由肛腺感染引起的。正常情况下，肛腺分泌的液体能起到润滑肛管的作用，但如果肛腺导管被堵塞，就会导致感染，进而引发肛周脓肿。据统计，约90%的肛周脓肿是因肛腺感染所致。
肛腺感染引发的具体情况
肛腺导管堵塞： 大便干结等情况可能会压迫肛腺导管，使其发生堵塞。比如长期便秘的人，大便过硬，通过肛管时容易挤压肛腺导管，导致分泌物引流不畅，细菌就容易在肛腺内繁殖。细菌感染肛腺： 当肛腺导管堵塞后，肠道内的大肠杆菌等细菌就会在肛腺内滋生，引发炎症。这些细菌不断繁殖，炎症逐渐加重，就会向周围组织蔓延，形成肛周脓肿。
肛周皮肤破损导致感染
外伤引起破损： 肛周皮肤如果受到外伤，比如被异物划伤、肛门部位受到撞击等，皮肤的完整性被破坏，细菌就有了可乘之机。例如，有些人在进行剧烈运动时，可能会意外伤到肛门周围皮肤，细菌侵入后就可能引发感染。肛门部位清洁不当： 肛门周围的皮肤褶皱多，如果清洁不彻底，容易残留粪便等污染物，这些污染物会滋生细菌，长期刺激肛周皮肤，也可能导致皮肤破损后感染，进而发展为肛周脓肿。比如有些人不注意便后清洁，肛周皮肤长时间处于被污染的环境中，就增加了感染风险。
全身性疾病影响
糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖控制不佳，身体的抵抗力会下降。高血糖环境有利于细菌生长繁殖，所以糖尿病患者更容易发生肛周感染，进而引发肛周脓肿。研究发现，糖尿病患者发生肛周脓肿的概率比正常人高2 - 5倍。免疫功能低下者： 像艾滋病患者或者长期使用免疫抑制剂的人，自身免疫系统功能减弱，对细菌等病原体的抵御能力降低，容易受到细菌感染，从而增加了患上肛周脓肿的可能性。这类人群一旦感染细菌，就更难依靠自身免疫力来清除病原体，感染容易扩散形成肛周脓肿。