肛周脓肿主要是肛腺感染引起的。正常情况下，肛腺分泌的液体能润滑肠道帮助排便，当肛腺开口被堵塞，比如粪便干结划伤肛窦，就容易引发感染，感染蔓延到周围间隙就形成肛周脓肿。据统计，约90%的肛周脓肿由肛腺感染起始。
肛腺感染相关因素
粪便干结因素： 当大便过于干结时，在通过肛管直肠部位时，很容易划伤肛窦，使得肛腺开口被堵塞，像长期便秘的人就更容易出现这种情况，干结粪便反复刺激肛窦，增加肛腺感染风险。腹泻因素： 频繁腹泻会让肠道分泌物增多，也可能刺激肛窦，破坏肛窦的正常防御功能，进而导致肛腺感染，比如一些肠道炎症患者容易反复腹泻，就增加了肛周脓肿发生几率。
自身免疫力因素
免疫力低下人群： 比如患有糖尿病的人，由于血糖控制不佳，身体的免疫力会受到影响，白细胞的杀菌能力下降，更容易受到细菌感染，包括肛腺部位的感染，从而增加肛周脓肿发生概率。长期使用免疫抑制剂人群： 像一些器官移植后需要长期服用免疫抑制剂来防止排异反应的患者，他们的免疫系统处于被抑制状态，对细菌等病原体的抵御能力减弱，肛腺感染后就容易发展成肛周脓肿。
局部卫生因素
不注意清洁人群： 肛门周围容易残留粪便等污物，如果不注意日常清洁，这些污物会滋生细菌，细菌容易侵入肛窦引发感染，比如有些不爱清洗肛门的人，就更容易出现肛周脓肿问题。局部潮湿因素： 比如长期处于潮湿环境，像一些久坐且局部通风不好的人，肛门周围皮肤容易潮湿，这种潮湿环境利于细菌繁殖，也会增加肛腺感染进而引发肛周脓肿的风险。