脊柱炎的成因较为复杂，目前认为主要与遗传、感染以及免疫因素等有关。其中遗传因素占据重要地位，比如有研究表明，约90%的强直性脊柱炎患者携带人类白细胞抗原B27（HLA - B27），比普通人群中HLA - B27的携带率高很多。
遗传因素方面
基因遗传关联： 强直性脊柱炎具有明显的家族遗传倾向，如果家族中有亲属患有脊柱炎，那么其他成员患病的风险会显著增加。HLA - B27基因的遗传传递使得个体更容易受到脊柱炎相关致病因素的影响，从而引发脊柱关节的炎症病变。
感染因素方面
细菌感染影响： 某些细菌感染可能会诱发脊柱炎。例如，肺炎克雷伯菌等细菌与脊柱炎的发病可能存在关联。这些细菌的某些成分可能与人体自身组织具有相似性，当人体感染这类细菌后，免疫系统在攻击细菌的同时，也会误伤到自身的脊柱关节组织，导致炎症反应的发生，进而引发脊柱炎。病毒感染相关： 一些病毒感染也可能在脊柱炎的发病中起到一定作用。虽然具体的作用机制还在进一步研究中，但有证据显示病毒感染可能会影响人体的免疫调节机制，使得免疫系统失衡，增加患脊柱炎的可能性。
免疫因素方面
免疫失衡表现： 人体的免疫系统失调是引发脊柱炎的重要原因之一。正常情况下，免疫系统能够精准地识别和抵御外来病原体的入侵。但在脊柱炎患者体内，免疫系统出现紊乱，自身的免疫细胞会错误地攻击脊柱关节部位的组织，导致关节出现炎症、疼痛、僵硬等一系列脊柱炎的症状。例如，免疫系统中的T细胞等免疫细胞功能异常，导致炎症因子大量释放，持续刺激脊柱关节，造成关节的损伤和病变。