脊椎炎的成因较为复杂，其中遗传因素是一个重要方面，约90%的脊椎炎患者与人类白细胞抗原B27（HLA - B27）基因相关，该基因阳性人群患脊椎炎的风险比阴性人群高很多。
遗传因素方面
HLA - B27基因关联：研究发现，HLA - B27基因在脊椎炎的发病中起着关键作用。携带HLA - B27基因的人群，其免疫系统容易出现异常反应，使得身体的免疫细胞错误地攻击脊椎部位的组织，从而引发炎症反应，导致脊椎炎的发生概率明显高于不携带该基因的人群。
感染因素方面
肠道细菌感染影响：某些肠道细菌与脊椎炎的发生可能存在关联。例如，克雷伯菌等肠道细菌的某些成分与人体脊椎关节的成分有相似之处，当人体感染这类细菌后，免疫系统在清除细菌的过程中，可能会误将脊椎关节组织当作细菌成分进行攻击，进而诱发脊椎关节的炎症，逐步发展为脊椎炎。
环境因素方面
潮湿寒冷环境刺激：长期处于潮湿、寒冷的环境中，也可能增加脊椎炎的发病风险。因为潮湿寒冷的环境会影响人体的血液循环，导致脊椎部位的血液循环不畅，局部组织的营养供应不足，同时还可能使肌肉紧张，对脊椎关节产生不良影响，使得脊椎关节更容易受到炎症的侵袭，长期下来就可能引发脊椎炎。