疲劳综合症常见的症状有持续或反复发作的疲劳感，这种疲劳感通常持续至少6个月以上，且休息后无法缓解。
身体方面的症状
肌肉疼痛： 全身多部位可能出现肌肉疼痛，比如颈部、肩部、腰部等肌肉较集中的区域，疼痛程度可轻可重，有的患者会感觉像被重物击打般酸痛。睡眠障碍： 很多疲劳综合症患者会有睡眠问题，表现为入睡困难、睡眠浅易醒等，即使睡了很长时间，醒来后仍感觉没休息好，精神状态不佳。
神经系统症状
记忆力减退： 患者会发现自己最近记忆力明显下降，比如经常忘记刚说过的话、刚做过的事，影响日常生活和工作。注意力不集中： 很难长时间专注于一件事情，比如工作时容易走神，学习时也不能很好地集中精力听讲或看书。
其他系统症状
消化系统症状： 可能出现食欲不振的情况，对平时喜欢的食物也提不起兴趣，还可能伴有腹胀、消化不良等问题。免疫系统症状： 身体抵抗力下降，容易反复感冒，而且感冒后恢复的时间比正常人要长，比如正常人感冒一周左右能好，患者可能需要两周甚至更久才能痊愈。