药流后出血时间长不干净即药流不尽，清宫是否会痛取决于具体方式。
一、会疼痛。如果采用普通清宫方法且未提前麻醉，在操作过程中，由于牵拉子宫会刺激子宫韧带，且清宫时损伤子宫内膜，会引发剧烈疼痛和下坠感。
二、不会疼痛。若在清宫前先进行麻醉，让患者失去意识后再手术操作，就不会产生疼痛。清宫术后会有肚子疼痛和阴道出血，需要多休息，避免劳累和着凉，一个月内禁止同房，并要遵医嘱到医院复查。
总结概况提示：本文主要阐述了药流不尽后清宫的疼痛情况取决于方式，普通清宫会痛而麻醉后清宫不痛，还提到了清宫术后的注意事项。