肾病综合症的引起原因较多，其中原发性肾病综合症的病因目前尚不明确，可能与自身免疫紊乱有关。而继发性肾病综合症则有多种明确因素。
感染因素相关
细菌感染：比如链球菌感染可能是诱因之一，有研究发现部分肾病综合症患者发病前有链球菌感染病史，像上呼吸道链球菌感染后，机体产生免疫反应，可能引发肾脏病变导致肾病综合症。病毒感染：乙肝病毒感染也和肾病综合症有一定关联，乙肝病毒相关的肾炎可表现为肾病综合症的症状，大约有5% - 10%的乙肝患者会出现肾脏受累并呈现肾病综合症的情况。
免疫性疾病相关
系统性红斑狼疮：这是一种自身免疫性疾病，多见于女性。当患者患有系统性红斑狼疮时，自身免疫系统会攻击自身组织器官，肾脏是常见的受累部位，约50%以上的系统性红斑狼疮患者会出现肾病综合症样的表现，出现大量蛋白尿、低蛋白血症等肾病综合症的典型特征。过敏性紫癜：好发于儿童及青少年，当发生过敏性紫癜时，全身小血管会发生炎症反应，如果肾脏小血管受累，就可能导致肾病综合症，大约10% - 30%的过敏性紫癜患者会发展为肾病综合症。
代谢性疾病相关
糖尿病：糖尿病病程较长的患者，若血糖控制不佳，10年以上的糖尿病患者中约有30%会出现肾脏病变，其中一部分就表现为肾病综合症，主要是因为长期高血糖导致肾小球基底膜受损，出现大量蛋白尿等肾病综合症表现。淀粉样变性：原发性或继发性淀粉样变性可累及肾脏，当肾脏受累时，会影响肾脏的正常滤过等功能，进而引发肾病综合症，原发性淀粉样变性多见于中老年人群，继发性淀粉样变性常继发于慢性炎症性疾病等情况。