非经期褐色分泌物腰疼可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因和治疗方法：
1.排卵期出血：如果褐色分泌物出现在两次月经中间，可能是排卵期出血。这是由于排卵后雌激素水平下降，引起子宫内膜脱落而导致的出血。一般出血量较少，持续时间较短，无需特殊治疗。注意休息，保持外阴清洁即可。
2.妇科炎症：如阴道炎、宫颈炎、盆腔炎等，可能导致非经期褐色分泌物和腰疼。治疗方法包括使用抗生素、抗真菌药物或抗炎药物等，具体用药需根据炎症类型和病因确定。此外，还可以配合物理治疗、中药治疗等。
3.内分泌失调：内分泌紊乱可能导致月经失调和褐色分泌物。治疗方法包括调整生活方式（如保持良好的睡眠、饮食均衡、减少压力等）、药物治疗（如使用孕激素、雌激素等）。具体治疗方案应根据个体情况制定。
4.子宫内膜息肉、子宫肌瘤等：这些良性病变也可能引起非经期褐色分泌物和腰疼。治疗方法通常包括手术切除息肉或肌瘤，或者使用药物（如孕激素等）来调节月经。
5.其他原因：如放置宫内节育器、宫颈癌、子宫内膜癌等也可能导致类似症状。需要进一步检查，如宫颈涂片、B超、宫腔镜等，以明确诊断并采取相应的治疗措施。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体治疗方案应根据个人情况和医生的建议来确定。如果出现非经期褐色分泌物和腰疼等异常症状，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以便针对性地治疗。此外，保持良好的生活习惯，如规律作息、均衡饮食、减少性生活等，有助于预防和缓解这些症状。