口腔溃疡反复发作可能由多种原因引起，比如约20% - 30%的人有复发性阿弗他溃疡，其发病与多种因素相关。
一、免疫因素
自身免疫反应异常： 当人体的免疫系统出现紊乱时，可能会攻击自身口腔黏膜组织，从而引发口腔溃疡反复发作。例如，一些自身免疫性疾病患者，如白塞病患者，往往会频繁出现口腔溃疡，同时还可能伴有眼部病变、生殖器溃疡等症状。免疫功能低下： 当人体免疫功能低下时，如老年人、长期患有慢性疾病（如糖尿病等）的人群，身体抵抗外界病原体的能力减弱，就更容易受到病原体的侵袭，进而导致口腔溃疡反复发作。比如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体抵抗力下降，口腔溃疡就容易反复出现且不易愈合。
二、遗传因素
家族遗传倾向： 研究发现，复发性口腔溃疡具有一定的遗传倾向。如果父母双方都有复发性口腔溃疡的病史，那么子女患复发性口腔溃疡的概率会比普通人群高很多。比如，父母一方患有复发性口腔溃疡，子女患病几率可能在25% - 50%左右；如果父母双方都患病，子女患病几率可能会达到50% - 75%。基因易感性： 某些基因的易感性也与口腔溃疡反复发作相关。携带特定基因的人群，对口腔溃疡的易感性增加，更容易出现口腔溃疡反复发作的情况。目前已经发现一些与口腔溃疡发病相关的基因位点，这些位点的存在使得个体更容易受到各种因素的影响而发生口腔溃疡。
三、系统性疾病因素
消化系统疾病： 如胃溃疡、十二指肠溃疡、溃疡性结肠炎、慢性胃炎等消化系统疾病，会影响人体对营养物质的消化吸收，导致机体缺乏一些必要的维生素、微量元素等，从而引发口腔溃疡反复发作。例如，患有胃溃疡的患者，由于消化功能受到影响，可能会缺乏维生素B族等，进而容易出现口腔溃疡。内分泌紊乱： 女性在月经周期、妊娠期等特殊时期，体内内分泌水平会发生变化，容易出现内分泌紊乱，这可能会诱发口腔溃疡反复发作。比如，有些女性在月经前会出现口腔溃疡加重的情况，这与月经前体内雌激素水平变化等内分泌因素有关。
四、环境因素
精神因素： 长期精神紧张、焦虑、压力过大等精神因素会影响人体的神经内分泌系统，导致机体免疫功能失调，从而增加口腔溃疡反复发作的几率。比如，学生在考试期间、上班族工作压力大时，口腔溃疡更容易反复出现。饮食因素： 长期挑食、偏食，导致维生素（如维生素B1、B2、B6等）、微量元素（如锌、铁等）摄入不足，也会引发口腔溃疡反复发作。例如，长期不吃蔬菜、水果的人，容易缺乏维生素C、B族维生素等，进而增加口腔溃疡的发病风险。另外，经常食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，会刺激口腔黏膜，也容易导致口腔溃疡反复发作。