怀孕36周腰疼的原因主要有以下两点：一是腰部劳损，二是腰椎间盘突出。
一、腰部劳损：怀孕36周属于孕晚期，此时子宫会逐渐增大。随着子宫的不断增大，腰部所承受的压力也会相应增大，进而对腰部形成压迫。长时间如此，就容易导致腰部劳损，从而出现疼痛症状，这种情况在孕晚期较为常见，属于正常现象。
二、腰椎间盘突出：到了怀孕36周时，子宫和胎儿都已比较大，这会使得腰椎的承重明显加重，同时还会改变腰椎的受力情况。在这些因素的综合作用下，就可能诱发腰椎间盘突出，进而引起腰疼。
总之，怀孕36周出现腰疼可能是由腰部劳损或腰椎间盘突出等原因导致的，需要密切关注自身状况，如有异常应及时就医。