新生儿黄疸下去又上来，可能与多种因素有关。一般来说，新生儿生理性黄疸有一定的消退和反复情况，但如果是病理性黄疸，下去又上来的原因可能有以下几方面。
胆红素生成过多方面
红细胞破坏过多： 新生儿出生后，若存在血型不合等情况，会导致红细胞大量破坏，使得胆红素产生过多。比如ABO血型不合或Rh血型不合，这会让胆红素生成量远超肝脏的处理能力，从而出现黄疸下去又上来的情况。肝肠循环增加： 新生儿肠道内正常菌群尚未完全建立，会影响胆红素的代谢。当肠道内的结合胆红素不能被正常转化为尿胆原等排出体外，就会被肠道重吸收进入血液循环，使得血液中胆红素水平升高，引发黄疸反复。
肝脏胆红素代谢障碍方面
肝脏摄取胆红素能力不足： 新生儿肝脏内的Y、Z蛋白含量较低，这会影响肝脏对胆红素的摄取。例如，早产儿的肝脏功能相对更不成熟，Y、Z蛋白含量比足月儿更低，摄取胆红素的能力更弱，就容易出现黄疸消退后又升高的情况。肝脏结合胆红素能力差： 肝脏中的尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶（UGT）活性不足，会导致胆红素与葡萄糖醛酸结合形成结合胆红素的过程受到影响。足月儿的UGT活性要到出生后1周左右才逐渐接近正常，早产儿则更低，所以在出生后的一段时间内，容易出现黄疸反复。
胆汁排泄障碍方面
胆管堵塞： 新生儿如果存在胆道闭锁等情况，会导致胆汁排泄不畅。胆汁中的胆红素不能顺利排出体外，就会反流入血，引起胆红素水平升高，使得黄疸下去后又上来。比如先天性胆道闭锁，这是一种比较常见的导致新生儿病理性黄疸反复的原因。排泄功能缺陷： 一些新生儿可能存在先天性的胆汁排泄功能缺陷，使得结合胆红素不能正常排到肠道中，而是淤积在体内，进而导致黄疸反复出现。