左侧睾丸隐隐作痛是否会自愈，需要根据具体情况来判断。以下是一些可能的原因和处理方法：
1.睾丸扭转：这是一种急症，需要立即就医。如果睾丸扭转得不到及时治疗，可能会导致睾丸坏死，需要手术切除。
2.附睾炎或睾丸炎：这是睾丸疼痛的常见原因之一。附睾炎和睾丸炎通常由细菌感染引起，需要使用抗生素治疗。在治疗期间，应避免过度劳累和性生活，保持局部清洁。
3.精索静脉曲张：精索静脉曲张是一种血管病变，可导致睾丸静脉回流不畅，引起疼痛。轻度精索静脉曲张可能无需治疗，但严重的精索静脉曲张可能需要手术治疗。
4.睾丸损伤：如果左侧睾丸受到外伤，如撞击、踢伤等，可能会导致疼痛。这种情况下，需要休息一段时间，避免剧烈运动和性生活，观察疼痛是否缓解。如果疼痛持续不缓解或加重，应及时就医。
5.其他原因：左侧睾丸隐隐作痛还可能与前列腺炎、精囊炎、阴囊炎等疾病有关。
总之，左侧睾丸隐隐作痛的原因有很多，有些情况下可能会自愈，有些情况下则需要及时就医治疗。如果疼痛持续时间较长、加重或伴有其他症状，如发热、恶心、呕吐等，应尽快就医，以便明确诊断并进行相应的治疗。