系统性红斑狼疮的病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与以下因素有关。一般认为遗传因素在其中起到重要作用，据统计，有系统性红斑狼疮家族史的人群患病风险比无家族史人群高。
遗传因素方面
基因携带风险： 特定的基因位点与系统性红斑狼疮的发病相关。例如，某些人类白细胞抗原（HLA）基因的变异会增加患病几率。如果家族中有亲属患有系统性红斑狼疮，那么其他家庭成员携带相关易感基因的概率会升高。遗传易感性传递： 这种遗传易感性不是绝对会发病，但相比普通人，携带相关基因的人在遇到其他诱发因素时，更容易触发免疫系统异常，从而引发系统性红斑狼疮。
环境因素影响
紫外线照射： 紫外线中的紫外线B（UVB）和紫外线A（UVA）可能会诱发系统性红斑狼疮。有研究表明，约1/3的系统性红斑狼疮患者在日晒后会病情加重或复发。长时间暴露在阳光下，皮肤细胞受到紫外线损伤，会释放自身抗原，进而激活免疫系统，导致自身免疫反应的发生。感染因素： 某些病毒感染可能与系统性红斑狼疮的发病有关。比如EB病毒、C型肝炎病毒等。病毒感染后可能会改变人体细胞的结构和功能，使得免疫系统错误地将自身组织识别为外来病原体，从而启动异常的免疫应答，引发系统性红斑狼疮。
雌激素的作用
女性高发倾向： 系统性红斑狼疮在女性中的发病率明显高于男性，尤其是在育龄期女性中更为常见。这与雌激素水平密切相关。雌激素可以影响免疫系统的功能，促进B淋巴细胞的活化和抗体的产生。在雌激素的作用下，免疫系统可能会出现紊乱，增加自身免疫性疾病的发生风险。例如，青春期女性和育龄期女性体内雌激素水平相对较高，患病几率相对更高。