系统性红斑狼疮的病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与以下因素有关。一般认为遗传因素在其中起到重要作用，据统计，有家族成员患系统性红斑狼疮的人群，其发病风险比无家族史人群高。
遗传因素方面
基因关联： 多个基因与系统性红斑狼疮的发病相关。例如，人类白细胞抗原（HLA）基因区域的某些位点与该病易感性密切相关。如果家族中有直系亲属患有系统性红斑狼疮，那么其他家庭成员携带相关易感基因的概率会增加。遗传易感性传递： 这种遗传易感性不是绝对会发病，但会使个体比常人更易受到其他因素影响而诱发疾病。比如，携带特定HLA基因的人，在遇到环境等诱因时，更容易触发自身免疫系统异常反应，从而引发系统性红斑狼疮。
环境因素影响
紫外线照射： 紫外线中的紫外线B（UVB）和紫外线A（UVA）都可能诱发系统性红斑狼疮。有研究表明，长期暴露在阳光下的人群，尤其是皮肤容易被晒到的部位，患系统性红斑狼疮的风险相对较高。比如在夏季，长时间户外活动且未做好防晒措施的人，皮肤受到紫外线刺激后，可能会激活自身免疫系统，导致免疫紊乱，进而增加患病几率。某些药物： 一些药物可能会诱发系统性红斑狼疮样症状。例如，抗癫痫药物中的苯妥英钠、抗心律失常药物中的普鲁卡因胺等，长期服用这些药物的人群，患类似系统性红斑狼疮疾病的风险会有所上升。但不同个体对药物的反应不同，并非所有服用这些药物的人都会发病，只是相对风险增加。
雌激素的作用
女性高发倾向： 系统性红斑狼疮在女性中的发病率明显高于男性，尤其是在生育年龄的女性中更为常见。这与雌激素水平密切相关。雌激素可以影响免疫系统的功能，当女性体内雌激素水平波动较大时，比如在青春期、孕期、产后以及服用含雌激素的药物等情况下，可能会促使免疫系统失衡，从而增加患系统性红斑狼疮的可能性。例如，孕期女性由于体内雌激素水平大幅升高，部分原本有遗传易感性的女性就可能在孕期发病或使病情加重。