喉咙两侧疼可能由多种原因引起，比如急性扁桃体炎，这种情况较为常见，通常由细菌或病毒感染导致，其中A组乙型溶血性链球菌是常见的致病菌之一。
一、感染性因素
1. 细菌感染：
链球菌感染： A组乙型溶血性链球菌感染是引发喉咙两侧疼较常见的细菌因素。这种感染通常会让喉咙黏膜明显充血、肿胀，扁桃体可能会肿大，甚至有脓性分泌物附着。一般起病比较急，患者会感觉喉咙两侧剧烈疼痛，可能还伴有发热，体温可达到38℃以上。葡萄球菌感染： 金黄色葡萄球菌等葡萄球菌感染也可能导致喉咙两侧疼，感染后局部炎症反应明显，会出现疼痛、红肿，严重时可能影响吞咽功能。
2. 病毒感染：
腺病毒感染： 腺病毒感染引起的喉咙两侧疼，常伴有咽部充血，可能同时出现眼睛发红等症状，全身症状相对明显，比如乏力、头痛等，病程一般在1 - 2周左右。流感病毒感染： 由流感病毒引起的喉咙两侧疼，往往还伴随全身肌肉酸痛、高热等症状，体温可迅速升高到39℃ - 40℃，发病较急。
二、非感染性因素
1. 环境因素：
干燥空气刺激： 长时间处于干燥的环境中，比如冬季暖气房内空气湿度较低，会使喉咙黏膜水分流失，导致喉咙两侧干燥、疼痛，尤其是在说话较多后疼痛会加重。粉尘刺激： 工作或生活环境中粉尘较多，粉尘颗粒刺激喉咙黏膜，也会引发喉咙两侧疼痛，脱离粉尘环境后，症状可能会有所缓解，但如果长期暴露，疼痛可能会持续存在。
2. 用嗓过度：
职业用嗓人群： 教师、歌手等职业用嗓人群，长时间高强度用嗓，会使喉咙两侧的声带、黏膜等受到损伤，出现疼痛，一般休息后可稍有缓解，但如果持续用嗓，疼痛会加重。非职业用嗓人群： 偶尔长时间大声说话、唱歌等，也可能导致喉咙两侧疼，比如连续K歌几小时后，就可能出现这种情况。
3. 过敏因素：
花粉过敏： 在花粉传播的季节，吸入花粉后引发过敏反应，除了会有鼻子痒、打喷嚏等症状外，也可能出现喉咙两侧过敏反应导致的疼痛，还可能伴有喉咙发痒等表现。食物过敏： 对某些食物过敏，比如吃了海鲜后过敏，可能会出现喉咙两侧肿胀、疼痛，同时可能伴有皮肤瘙痒、皮疹等其他过敏症状。